El hospital ha sido premiado en tres categorías de los II Premios Sanitaria 2000 a la Sanidad de la Comunidad de Madrid, por el trabajo realizado por los Servicios de Cirugía Plástica, Neurología y el Instituto de Investigación Biomédica IdiPAZ, durante el año 2010 en mejora del sistema sanitario madrileño.
El Servicio de Cirugía Plástica de La Paz, que dirige el doctor Cesar Casado, recibió el premio al mejor Servicio Hospitalario por su trabajo con células grasas extraídas de la propia piel del paciente mediante un proceso de succión y centrifugado.
El Instituto de Investigación Biomédica IdiPAZ, junto con los otros cuatro institutos madrileños, IIS-Princesa, Irycis, I+12 y el Instituto de Investigación de la Fundación Jiménez Díaz han sido reconocidos en la categoría de Campaña o Acción Investigadora.
La Campaña o Acción Sanitaria más destacada han sido el Plan de Ictus de la Comunidad de Madrid desarrollado por el Servicio de Neurología del Hospital La Paz que dirige el doctor Exuperio Díez-Tejedor.